La Federación y sus cooperativas afiliadas cuentan con el respaldo normativo del Estado, a través de la LEY GENERAL DE COOPERATIVAS Y SU REGLAMENTO. Tanto las cooperativas afiliadas como la Federación, se rigen actualmente por un modelo propio de autorregulación, no obstante existir por parte del Estado la Inspección General de Cooperativas (INGECOOP), entidad responsable de supervisar a todo el sector cooperativo en general. También somos personas obligadas ante la Intendencia de Verificación Especial, de la Superintendencia de Bancos, para efectos de la aplicación de la Ley Contra el Lavado de Dinero y Otros Activos y de la Ley para Prevenir y Reprimir el Financiamiento del Terrorismo. Además, se envía información contable de cada cooperativa al Banco de Guatemala y a la Superintendencia de Bancos en forma trimestral, por requerimiento de estas instituciones.

La autorregulación de la federación y cooperativas afiliadas se ejerce a través de las siguientes instancias e instrumentos:

- Auditoria Interna: Departamento que forma parte de la estructura de la federación y de las cooperativas afiliadas, principalmente de las grandes.

- Normativa Prudencial: Conjunto de normas adoptadas en consenso por la federación y cooperativas afiliadas, que regulan sus operaciones y promueven una sana intermediación financiera, con enfoque a la prevención de riesgos.

- Sistema de Indicadores Financieros P.E.R.LA.S.: Sistema automatizado de indicadores de alerta temprana, utilizado para evaluar periódicamente la salud financiera de la federación y cooperativas afiliadas.

- Comisión de Vigilancia: En las cooperativas es un órgano integrado por asociados y en la Federación es un órgano conformado por representantes de las cooperativas afiliadas, los que pueden ser empleados o asociados a las mismas. En ambos casos, los miembros son electos en asamblea general y su función es controlar y fiscalizar las operaciones de la institución y las actividades del Consejo de Administración.

- Auditoria Externa: Servicio proporcionado por firmas independientes de reconocido prestigio.